A son ouverture en 1913, le fort pouvait accueillir plus de 300 militaires Bien qu'appartenant au Ministère de la Défense jusqu'en 1975, le fort a surtout servi de prison. Fort bij Spijkerboor est conservé dans le but d'expliquer les différentes fonctions des forts au cours des années. Il permet de présenter l'histoire sous différentes perspectives, et pas uniquement d'un point de vue militaire:  on y retrouve des traces faisant allusions aux inondations de 1916, aux Guerre Mondiales, à la Crise Indonésiennes et à la Guerre Froide.